Výskum ukázal, že užívanie čierneho (živočíšneho) uhlia môže už za krátky čas narušiť črevnú mikroflóru hrubého a tenkého čreva. Čierne uhlie patrí do kategórie hydrofilných sorbentov, ktoré pri dlhodobom používaní (nad 10 dní) môžu vyvolať atóniu čriev.